Cấu trúc tinh thể là gì? Các công bố khoa học về Cấu trúc tinh thể
Cấu trúc tinh thể là mô tả vị trí và mối liên kết giữa các nguyên tử, phân tử hoặc ion trong một tinh thể. Mô tả này xác định sự sắp xếp không gian của các điểm...
Cấu trúc tinh thể là mô tả vị trí và mối liên kết giữa các nguyên tử, phân tử hoặc ion trong một tinh thể. Mô tả này xác định sự sắp xếp không gian của các điểm mạng trong tinh thể, tạo ra một mô hình để hiểu và dự đoán các tính chất vật lý và hóa học của tinh thể đó. Cấu trúc tinh thể có thể được mô tả bằng một số phương pháp như phân tử học, đàn kế hoạch và phân tử tổng hợp tinh thể.
Cấu trúc tinh thể xác định tình trạng sắp xếp không gian của các hạt nhỏ (nguyên tử, phân tử, ion) trong một mẫu tinh thể. Mỗi hạt nhỏ được gọi là tạp chất và được gọi là nút hoặc điểm mạng. Cấu trúc tinh thể quyết định sự phối trí, khoảng cách giữa các tạp chất, và tổ chức không gian của chúng.
Tử tập hợp các điểm mạng tạo thành một mốc lưới không gian, trong đó mỗi nút được liên kết với các nút láng giềng xung quanh bằng các quy tắc cụ thể. Có nhiều cách khác nhau để mô tả cấu trúc tinh thể, nhưng một số mô hình phổ biến nhất bao gồm:
1. Mô hình Hình học: Mô hình này miêu tả tọa độ không gian của các nút trong hệ tọa độ 3 chiều, trong đó mỗi điểm được xác định bằng các giá trị x, y và z.
2. Mô hình Sống thu: Mô hình này sử dụng các véc-tơ chỉ dẫn từ một nút tới các nút láng giềng xung quanh để mô tả mối liên kết và phối trí của các tạp chất trong tinh thể.
3. Mô hình Cấu trúc học: Mô hình này xem xét mối tương quan giữa các nút láng giềng, khoảng cách giữa chúng và góc liên kết để mô tả cấu trúc tinh thể.
Cấu trúc tinh thể có thể được xác định thông qua các phương pháp thực nghiệm như tia X, quang phổ tia X, quang phổ từ điển và quang phổ cộng hưởng từ. Các phương pháp tính toán như lý thuyết mật độ chức năng (DFT) và phương pháp lý thuyết tinh thể (CT) cũng có thể được sử dụng để phân tích và dự đoán cấu trúc tinh thể.
Cấu trúc tinh thể được mô tả bằng cách xác định các điểm mạng và mối liên kết giữa chúng. Một số khái niệm quan trọng liên quan đến cấu trúc tinh thể gồm:
- Nguyên tắc Pauli: Nguyên tắc này quy định rằng mỗi quá trình điện tử chỉ có thể tồn tại trong một trạng thái mà chỉ có một electron có thể bắt gặp.
- Ràng buộc nguyên tử: Ràng buộc này quy định mối quan hệ giữa các vị trí nguyên tử và cấu trúc không gian của tinh thể. Ví dụ, các nguyên tử trong mạng tinh thể kim loại thường có cấu trúc không gian gọn và chủ yếu có các mạng lưới đơn giản như lục phân, lập phương hoặc tam giác đơn giản.
- Định luật von Laue: Định luật này chỉ ra rằng các tia X phản xạ từ tinh thể sẽ tạo ra các hoa văn tuần hoàn, cho phép chúng ta xác định cấu trúc tinh thể bằng cách phân tích mô hình hoa văn này.
- Đơn vị tinh thể: Đây là đơn vị lặp lại nhỏ nhất của cấu trúc tinh thể, được nhân bản và mở rộng trong không gian để tạo thành cấu trúc tinh thể.
Cấu trúc tinh thể có thể được phân loại thành các loại khác nhau như tinh thể kim loại, tinh thể ion, tinh thể phân tử và tinh thể điện cực. Mỗi loại tinh thể có các đặc điểm cấu trúc độc đáo và tương tác không gian khác nhau giữa các tạp chất.
Danh sách công bố khoa học về chủ đề "cấu trúc tinh thể":
Kết quả của việc xác định cấu trúc tinh thể đơn khi ở định dạng CIF hiện đã có thể được xác thực một cách tự động. Theo cách này, nhiều lỗi trong các tài liệu được công bố có thể được tránh. Phần mềm xác thực sinh ra một bộ ALERTS nêu chi tiết các vấn đề cần được thực hiện bởi nhà thực nghiệm, tác giả, người phản biện và tạp chí xuất bản. Việc xác thực đã được tiên phong bởi tạp chí IUCr
Nghiên cứu này tập trung vào tình trạng kiệt sức và mặt trái tích cực của nó - mức độ tham gia. Một mô hình được kiểm tra, trong đó tình trạng kiệt sức và mức độ tham gia có những yếu tố dự đoán khác nhau và những hậu quả có thể khác nhau. Mô hình phương trình cấu trúc được sử dụng để phân tích dữ liệu đồng thời từ bốn mẫu nghề nghiệp độc lập (tổng cộng
Các ứng dụng mới như xe điện hỗn hợp và dự phòng nguồn điện yêu cầu pin có thể sạc lại kết hợp mật độ năng lượng cao với khả năng sạc và xả nhanh. Sử dụng mô hình tính toán từ đầu, chúng tôi xác định các chiến lược hữu ích để thiết kế các điện cực pin có tốc độ cao hơn và đã kiểm định chúng trên lithium niken mangan oxide [Li(Ni 0.5 Mn 0.5 )O 2 ], một vật liệu an toàn, giá rẻ nhưng được cho là có khả năng tốc độ kém. Bằng cách thay đổi cấu trúc tinh thể của nó, chúng tôi đã đạt được khả năng tốc độ cao đáng kinh ngạc, đáng kể hơn rất nhiều so với lithium coban oxide (LiCoO 2 ), vật liệu điện cực pin được lựa chọn hiện nay.
Các khoáng vật oxit mangan đã được sử dụng trong hàng nghìn năm—bởi người xưa để chế tạo thuốc nhuộm và làm trong suốt kính, và ngày nay là quặng mangan, xúc tác, và vật liệu cho pin. Hơn 30 khoáng vật oxit mangan xuất hiện trong nhiều bối cảnh địa chất khác nhau. Chúng là thành phần chính của các hạt mangan trải rộng trên diện tích lớn của đáy đại dương và đáy nhiều hồ nước ngọt. Các khoáng vật oxit mangan có mặt khắp nơi trong đất và trầm tích và tham gia vào nhiều phản ứng hóa học ảnh hưởng đến nước ngầm và thành phần đất. Sự xuất hiện điển hình của chúng dưới dạng hỗn hợp hạt mịn khiến việc nghiên cứu cấu trúc nguyên tử và hóa học tinh thể của chúng trở nên khó khăn. Tuy nhiên, trong những năm gần đây, các nghiên cứu sử dụng kính hiển vi điện tử truyền qua và các phương pháp nhiễu xạ tia X bột và neutron đã cung cấp những hiểu biết mới quan trọng về cấu trúc và tính chất của những vật liệu này. Cấu trúc tinh thể của todorokite và birnessite, hai trong số các khoáng vật oxit mangan phổ biến hơn trong các mỏ trên đất liền và hạt đại dương, đã được xác định bằng dữ liệu nhiễu xạ tia X bột và phương pháp tinh chỉnh Rietveld. Do các đường hầm lớn trong todorokite và các cấu trúc liên quan, có nhiều sự quan tâm trong việc sử dụng những vật liệu này và các đồng thúc đẩy tổng hợp như là xúc tác và tác nhân trao đổi cation. Các khoáng vật thuộc nhóm birnessite có cấu trúc lớp và dễ dàng trải qua các phản ứng oxy hóa khử và phản ứng trao đổi cation, đóng vai trò quan trọng trong việc kiểm soát hóa học nước ngầm.
Cấu trúc tinh thể của phức hợp hình thành bởi estradiol và miền gắn kết ligand của thụ thể estrogen-α người (hERαLBD) với độ phân giải 2,8-Å được mô tả và so sánh với cấu trúc mới công bố gần đây của phức hợp progesterone với miền gắn kết ligand của thụ thể progesterone người, cũng như với các cấu trúc tương tự của miền gắn kết ligand thụ thể nhân/steroid được giải quyết ở những nơi khác. Miền hERαLBD khi liên kết hormone hình thành ra một giao diện dimer khác biệt và có thể quan trọng hơn về mặt sinh lý so với phần tương ứng của progesterone. So sánh các yếu tố quyết định độ đặc hiệu của việc gắn kết hormone cho thấy một chủ đề cấu trúc chung của các tương tác hỗ trợ lẫn nhau của van der Waals và liên kết hydro liên quan đến các dư lượng bảo tồn cao. Cơ chế đề xuất trước đây mà thụ thể estrogen phân biệt nhóm 3-hydroxy độc đáo của estradiol từ chức năng 3-keto của hầu hết các steroid khác nay được mô tả chi tiết theo từng nguyên tử. Kết quả bản đồ từ các nghiên cứu đột biến cho thấy bề mặt gắn kết của đồng hoạt hóa bao gồm vùng xung quanh “trình tự chữ ký” cũng như helix 12, nơi mà cấu hình phụ thuộc ligand của lõi chức năng kích hoạt 2 là tương tự ở tất cả các miền gắn kết ligand thụ thể nhân/steroid đã được giải khác trước đây. Sự kiện đóng gói tinh thể đặc biệt đã làm dịch chuyển helix 12 trong miền hERαLBD được báo cáo ở đây, gợi ý mức độ biến động động cao hơn mong đợi cho cấu trúc phụ quan trọng này.
Chúng tôi đã nghiên cứu ảnh hưởng kích thước đến cấu trúc tinh thể của hạt nano barium titanate (BaTiO3) với kích thước 40, 140 và 430 nm, thông qua kỹ thuật tán xạ neutron và diffracting X-ray đồng bộ hóa có độ phân giải cao. Các mẫu này được chuẩn bị bằng phương pháp phân hủy nhiệt hai bước đã được sửa đổi từ barium titanyl oxalate, tạo ra rất ít tạp chất trong mạng tinh thể. Phân tích Rietveld của dữ liệu tán xạ neutron cho các hạt BaTiO3 kích thước 430 nm và 140 nm đã được thực hiện với giả định chỉ có một pha của cấu trúc lập phương (P4mm). Tỉ lệ trục c/a của BaTiO3 lập phương giảm với việc giảm kích thước hạt từ 430 xuống 140 nm. Các hạt barium titanate với kích thước 40 nm bao gồm (1) các tinh thể lập phương (83 wt %) có thể tích ô mạng lớn và tỉ lệ trục c/a = 1.000(5) và (2) một pha lục giác (P63mmc, 17 wt %) có thể tích ô mạng lớn. Phân tích Rietveld và phương pháp tối đa-entropy cho thấy có sự dịch chuyển nguyên tử từ vị trí lý tưởng của cấu trúc lập phương và hiện tượng cực địa tự phát của pha lập phương ngay cả trong các hạt BaTiO3 kích thước 40 nm. Phân bố mật độ hạt nhân của các hạt kích thước 140 nm với hằng số điện cao không cho thấy sự rối loạn vị trí lớn, trong khi nguyên tử Ba của BaTiO3 lập phương ở các hạt kích thước 40 nm có tham số dịch chuyển nguyên tử nhỏ hơn.
Công nghiệp hàng không vũ trụ cung cấp một động lực mạnh mẽ cho sự phát triển công nghệ. Gần đây, một lớp vật liệu composite mới cho môi trường khắc nghiệt, dựa trên composite gốm chịu nhiệt độ cực cao được gia cường bằng các sợi liên tục (UHTCMC), đang được phát triển. Mục tiêu của công trình này là khắc phục tình trạng dữ liệu rời rạc hiện có về tối ưu hóa vi cấu trúc và hành vi cấu trúc của chúng, bằng cách trình bày một đặc trưng cơ học nhất quán của các UHTCMC được xác định rõ ràng và phát triển dựa trên ma trận ZrB2. Các composite thu được có độ dày 3.7 g/cm3 và độ xốp dưới 10%. Độ bền uốn tăng từ 360 đến 550 MPa từ nhiệt độ phòng đến 1500 °C, cho thấy hành vi không giòn. Các composite có khả năng chịu đựng mức độ sốc nhiệt cao tới 1500 °C. Sự giảm tối đa độ bền tại 1400 °C là 16% so với giá trị ban đầu, chỉ ra rằng các mẫu có thể chịu sốc ở nhiệt độ cao hơn. Độ bền uốn, mô đun Young và hệ số giãn nở nhiệt (CTE) của các composite được đo cả theo hướng ngang và dọc và được liên kết với các đặc điểm vi cấu trúc. Đặc trưng vi cấu trúc và cơ học được trình bày định nghĩa rõ ràng tiềm năng của các UHTCMC và có thể được sử dụng làm tài liệu tham khảo cho việc thiết kế và phát triển các hệ thống bảo vệ nhiệt mới và các thành phần cấu trúc khác cho môi trường khắc nghiệt.
EstE1 là một esterase siêu nhiệt thuộc gia đình lipase nhạy cảm với hormone và được phân lập lần đầu tiên thông qua việc sàng lọc chức năng từ một thư viện metagenomic được tạo ra từ mẫu môi trường nhiệt độ cao. Các dimer và oligomer có thể đã được chọn lọc tiến hóa trong các vi sinh vật ưa nhiệt vì sự tương tác giữa các tiểu đơn vị có thể mang lại tính ổn định nhiệt cho protein. Các cơ chế phân tử của việc ổn định nhiệt của esterase cực kỳ ổn định này vẫn chưa được hiểu rõ do thiếu thông tin cấu trúc.
Chúng tôi báo cáo lần đầu tiên cấu trúc tinh thể của EstE1 với độ phân giải 2.1-Å. Cấu trúc ba chiều của EstE1 thể hiện một lớp α/β hydrolase cổ điển với một chiếc lá beta paralel ở giữa, được bao quanh bởi các xoắn alpha ở cả hai bên. Các dư lượng Ser154, Asp251, và His281 tạo thành motif ba phân tử xúc tác thường thấy trong các α/β hydrolase khác. EstE1 tồn tại dưới dạng một dimer được hình thành nhờ các tương tác kị nước và cầu muối. Quang phổ phân cực hình tròn và phân tích động học inactivation nhiệt của các đột biến EstE1, được tạo ra thông qua đột biến chỉ định tại chỗ dựa trên cấu trúc của các dư lượng amino acid tham gia vào dimer hóa EstE1, cho thấy rằng các tương tác kị nước thông qua Val274 và Phe276 trên sợi β8 của mỗi monomer đóng vai trò chính trong việc dimer hóa EstE1. Ngược lại, các cầu muối giữa các phân tử đóng góp ít hơn đáng kể vào quá trình dimer hóa và tính ổn định nhiệt của EstE1.
Những kết quả của chúng tôi gợi ý rằng các tương tác kị nước giữa các phân tử là điều cần thiết cho tính siêu ổn định nhiệt của EstE1. Cơ chế phân tử cho phép EstE1 chịu được nhiệt độ cao sẽ cung cấp hướng dẫn cho việc thiết kế hợp lý một esterase/lipase ổn định nhiệt bằng cách sử dụng các enzyme lipolytic có cấu trúc tương tự như EstE1.
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 10